辽东平定，田齐大赏三军，提升有功将士军衔、职级。同时，为了巩固对新占领地的统治，在高句丽和夫余划分出大片土地，奖赏给了各千户府。
汉军将士收获颇丰，除了钱财、奴隶，还分到了许多草场、田地。各军将士欢呼雀跃，开始打理行装，准备凯旋而归。
许多士兵还提前与府中计曹吏询问，如何从府中承包田地，如何派家人前来高句丽和夫余经营新的产业。
田齐与沮授商议之后，决定升李进为安东校尉，担任高句丽卫所掌军万户。同时调神机军府北迁，扩充兵员，负责留守高句丽。
任命索离为镇东校尉，高句丽卫所副万户，在夫余军、高句丽军降兵中挑选符合良家子身份军士，组建一府大汉骑军。因夫余人和高句丽人喜戴五色花帽，田齐将索离这府骑军命名为花帽军。
与此同时，沮授接到锦衣卫飞鸽传书，田畴和高卉亲自前往邴原家中探望，终于请得邴原出山，正乘船赶来集安。
田齐大喜，令童飞、江成派水军战船南下相迎。
数日之后，邴原被水军接回集安。田齐立刻召见邴原，与他商议组建高句丽卫所事宜。
邴原在接受田齐征令之前，早得管宁信件，知道田齐欲请他主管高句丽卫所民政事务，也大概了解了田齐所定的卫所制度。
等高卉和田畴亲自到他家中送达田齐征令，邴原立刻接受田齐征辟，举家北上，赶赴集安。
邴原在路上一直思考着如何推行田齐所定卫所制度。等到与田齐见面，他立刻向田齐提出数条建议。
邴原对田齐和沮授说道：“汉军攻打高句丽，历时半年，大战数场。高句丽军民死伤十余万，心怀怨恨。主公允许延优等高句丽降臣举族北迁，可顺便将有家人被汉军杀死的高句丽人交与延优，带去蛮荒。如有不愿北迁者，可贬为奴隶，分与府军军士。”
田齐轻轻点头，接受了邴原的建议。沮授也向邴原解释道：“高句丽有民数百万，又与大汉风俗有异，语言不通。要想安定地方，推行卫所制度，必须施之以威，示之以恩。主公允许延优等人举族北迁，就是担心高句丽贵族阶层反对卫所制度，鼓动臣民为乱。我们只担心延优带走的族人太少，却不怕他们带走的人多。根矩兄（邴原字）的建议甚好，正可将所有对大汉怀有敌意的高句丽人赶去北方谋生。”
田齐哈哈大笑，对沮授和邴原说道：“北方蛮荒之地宽广无垠，不知有几千、几万里远。世人皆以为那里荒芜贫瘠，无法安置百姓。其实不然。我曾只身前往鲜卑，从鲜卑人口中得知，在极北之地，也有人烟。据说北行万里，虽然天气极寒，但有半年时间，太阳终日不落。那时万里冰原将冰雪融化，牧草茂密，马、鹿成群。我允许延优率族人北迁，就是想让他们替大汉去开辟疆土。我要把他们的目光引向北方。只要他们不再南下袭扰大汉，我可以倾尽全力，帮助他们在北方立足。毕竟他们与我们血脉相同。”
邴原见田齐和沮授两人目光长远，真心为大汉北疆的长治久安考虑，不由疑虑尽去，继续建议道：“主公划分土地草场给各军府，引导府民北上经营家产，可以促进汉民北迁，有助高句丽百姓汉化。但府民富裕，北迁意愿不强，只怕人数不足。如今幽、冀、豫、青等州受天灾人祸荼毒，有流民数百万。主公可发布授田令，引流民北迁。一来可扩充各军府实力，二来可促进夫余、高句丽等族百姓与汉民融合。另外，还可于辽东发布放奴令，解放奴隶，北迁安置。”
田齐和沮授也有意招抚流民，立刻接受了邴原的建议。
田齐对邴原承诺道：“各府军即将北撤。我会令童飞、江成两府水军南下东莱，专门负责招抚流民。流民北迁安置所需财物、粮草由将军府负责。我会令冯振千户所部船队东行倭国、三韩，采购粮草。再令苏双派商队南下吴越和交州，采购粮食。”
邴原见田齐早有准备，欣然承诺，务必将北迁流民安置好。为了减少流民伤病，帮助流民适应北地气候，邴原请求田齐调派各府军中的医护营前来集安。此外，邴原还恳请田齐，依照夫余卫所的先例，在高句丽各千户所设立匠营学校，向百姓传授以煤取暖、营造火炕、养殖貂孤、搭建暖棚等技术。
田齐答应会派匠营千户何丰亲自来高句丽主持设立匠营学校，同时派匠营副千户童浩前往夫余。
邴原又询问田齐，他与李进同为卫所万户，如遇争执，以谁人为主。
田齐令沮授把将军府架构和府军制度详细述说一遍，然后对邴原说道：“遇战事，你部民政官员需全力配合李进行事。无战事，府军不得干涉政务。”
邴原这才放心，又询问他手下官吏如何调派。田齐笑道：“按将军府各部职责，此事由苏双负责。你和管宁也归苏双的政务部管理。卫所和府军官吏由政务部吏部分司负责，归曹性千户代管。在吏部分司没有下派官吏之前，你有权向吏部分司举荐人选。但你举荐之人需要吏部分司审核同意，方可上任。而且将军府各部司会指派官吏到卫所任职，建立各部司分支机构，归卫所和将军府双重管理。”
邴原点了点头，表示愿意接受将军府指派官吏，服从将军府各部司政令。他办学多年，手下弟子数十，皆跟随他北上集安。他原本想要把这些弟子，一一向田齐举荐，入高句丽各千户所任职。但现在来看，将军府官员任免自有制度，与大汉内地郡县不同，他根本无权任命手下官吏。但邴原也不会放任自己弟子不管，他暗自打算，准备让这些弟子从文书小吏做起，归入卫所各部司分支。
半个月后，各府军休整结束，高句丽卫所也组建成形，走上正轨。田齐下令各府军南撤。
魏延率海东军西行夫余，负责驻守岔河口和喜都岭。李进率神机军留守高句丽。其他各府军士开始沿江南下，返回各府军领地。
金藤的无当军在此战中损失最重，战死三分之一，重伤残疾百余，轻伤者数百。为帮助无当军快速南撤，田齐允许金藤率无当军搭乘水军船只。